Em Tóquio no ano de 2048, crimes brutais atribuídos a seres não humanos aterrorizam a cidade, e um misterioso homem chamado Origin os caça nas sombras . Na verdade, Origin é um androide protótipo que vive entre as pessoas como o funcionário da AEE Tanaka Jin, seguindo o comando de seu criador ("Pai") para "sobreviver" . Sem emoções, ele é forçado a destruir seus próprios "irmãos" robôs enquanto luta para esconder sua verdadeira identidade da colega de trabalho Mai, por quem passa a desenvolver sentimentos .